ОБНПрикладная биохимия и микробиология Applied Biochemistry and Microbiology

  • ISSN (Print) 0555-1099
  • ISSN (Online) 3034-574X

Идентификация возбудителя ложной мучнистой росы винограда Plasmopara viticola на основе количественной ПЦР

Код статьи
S0555109925010075-1
DOI
10.31857/S0555109925010075
Тип публикации
Статья
Статус публикации
Опубликовано
Авторы
Том/ Выпуск
Том 61 / Номер выпуска 1
Страницы
68-76
Аннотация
Предложен новый метод ранней идентификации возбудителя ложной мучнистой росы винограда Plasmopara viticola, основанный на методе количественной ПЦР в реальном времени (ПЦР РВ) с применением флуоресцентного красителя SYBR Green I. Разработаны шесть пар праймеров для ПЦР РВ для идентификации P. viticola, где пара праймеров PvITS1_2-real-s/a продемонстрировала наибольшую эффективность для раннего выявления ложной мучнистой росы винограда. Более того, была показана положительная корреляция (R = 0.86) при сравнении результатов ПЦР РВ с праймерами PvITS1_2-real-s/a с данными метатаксономического анализа по распространению P. viticola среди растений Дальневосточных видов и сортов винограда. Таким образом, ПЦР РВ с парой праймеров PvITS1_2-real-s/a, является дешевым и эффективным методом для раннего выявления и мониторинга бессимптомных инфекций P. viticola. Разработанный метод может послужить основой для прогнозирования эпидемий ложной мучнистой росы винограда и борьбы с ней на виноградниках.
Ключевые слова
стратегии управления заболеваниями растений милдью Vitis amurensis NGS
Дата публикации
12.09.2025
Год выхода
2025
Всего подписок
0
Всего просмотров
16

Библиография

  1. 1. Koledenkova K., Esmaeel Q., Jacquard C., Nowak J., Clément C., Ait Barka E. // Frontiers in Microbiology. 2022. V. 13. P. 889472. https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.889472
  2. 2. Toffolatti S.L., Russo G., Campia P., Bianco P.A., Borsa P., Coatti M., Torriani S.F., Sierotzki H. // Pest Management Science. 2018. V. 74. № 12. P. 2822–2834.
  3. 3. Toffolatti S.L., Serrati L., Sierotzki H., Gisi U., Vercesi A. // Pest Management Science. 2007. V. 63. № 2. P. 194–201.
  4. 4. Burruano S. // Mycologist. 2000. V. 14. № 4. P. 179–182.
  5. 5. Díez-Navajas A.M., Greif C., Poutaraud A., Merdinoglu D. // Micron. 2007. V. 38. № 6. P. 680–683.
  6. 6. Vercesi A., Sirtori C., Vavassori A., Setti E., Liberati D. // Med. Biol. Eng. Comput. 2000. V. 38. № 1. P. 109–112.
  7. 7. Vercesi A., Toffolatti S.L., Zocchi G., Guglielmann R., Ironi L. // Eur J Plant Pathol. 2010. V. 128. № 1. P. 113–126.
  8. 8. Hong C.-F., Scherm H. // Journal of Phytopathology. 2020. V. 168. № 5. P. 297–302.
  9. 9. Negrel L., Halter D., Wiedemann-Merdinoglu S., Rustenholz C., Merdinoglu D., Hugueney P., Baltenweck R. // Frontiers in Plant Science. 2018. V. 9. P. 360. https://doi.org/10.3389/fpls.2018.00360
  10. 10. Si Ammour M., Bove F., Toffolatti S.L., Rossi V. // Frontiers in Plant Science. 2020. V. 11. P. 1202. https://doi.org/10.3389/fpls.2020.01202
  11. 11. Valsesia G., Gobbin D., Patocchi A., Vecchione A., Pertot I., Gessler C. // Phytopathology. 2005. V. 95. № 6. P. 672–678.
  12. 12. Yang L., Chu B., Jie D., Yuan K., Sun Q., Jiang C., Ma Z. // Phytopathology Research. 2023. V. 5. № 1. P. 19. https://doi.org/10.1186/s42483-023-00178-w
  13. 13. Kong X., Qin W., Huang X., Kong F., Schoen C.D., Feng J. et al. // Sci Rep. Nature Publishing Group, 2016. V. 6. № 1. P. 28935. https://doi.org/10.1038/srep28935
  14. 14. Kiselev K.V., Nityagovsky N.N., Aleynova O.A. // Appl. Biochem. Microbiol. 2023. V. 59. № 3. P. 361–367.
  15. 15. Nityagovsky N.N., Ananev A.A., Suprun A.R., Ogneva Z.V., Dneprovskaya A.A., Tyunin A.P. et al. // Horticulturae. 2024. V. 10. № 4. P. 326. https://doi.org/10.3390/horticulturae10040326
  16. 16. Ye J., Coulouris G., Zaretskaya I., Cutcutache I., Rozen S., Madden T.L. // BMC Bioinformatics. 2012. V. 13. № 1. P. 134. https://doi.org/10.1186/1471-2105-13-134
  17. 17. Robideau G.P., De COCK A.W. a. M., Coffey M.D., Voglmayr H., Brouwer H., Bala K. et al. // Molecular Ecology Resources. 2011. V. 11. № 6. P. 1002–1011.
  18. 18. Choi Y.-J., Beakes G., Glockling S., Kruse J., Nam B., Nigrelli L. et al. // Molecular Ecology Resources. 2015. V. 15. № 6. P. 1275–1288.
  19. 19. Kiselev K.V., Aleynova O.A., Grigorchuk V.P., Dubrovina A.S. // Planta. 2017. V. 245. № 1. P. 151–159.
  20. 20. R Core Team // R Foundation for Statistical Computing. 2021. https://www.r-project.org/
  21. 21. Kassambara A. // ggpubr: “ggplot2” Based Publication Ready Plots. R package. 2023. https://rpkgs.datanovia.com/ggpubr/
  22. 22. Lou D., Meurer M., Ovchinnikova S., Burk R., Denzler A., Herbst K. et al. // EMBO reports. 2023. V. 24. № 5. P. e57162. https://doi.org/10.15252/embr.202357162
  23. 23. Mouafo-Tchinda R.A., Beaulieu C., Fall M.L., Carisse O. // Canadian Journal of Plant Pathology. 2021. V. 43. № 1. P. 73–87.
QR
Перевести

Индексирование

Scopus

Scopus

Scopus

Crossref

Scopus

Высшая аттестационная комиссия

При Министерстве образования и науки Российской Федерации

Scopus

Научная электронная библиотека