ОБНПрикладная биохимия и микробиология Applied Biochemistry and Microbiology

  • ISSN (Print) 0555-1099
  • ISSN (Online) 3034-574X

БИОСИНТЕЗ СУБЕРИНОВОЙ КИСЛОТЫ ИЗ ГЛЮКОЗЫ ПО ОБРАЩЕННОМУ β-ОКИСЛЕНИЮ ЖИРНЫХ КИСЛОТ РЕКОМБИНАНТНЫМИ ШТАММАМИ Escherichia coli

Код статьи
S3034574XS0555109925020031-1
DOI
10.7868/S3034574X25020031
Тип публикации
Статья
Статус публикации
Опубликовано
Авторы
Том/ Выпуск
Том 61 / Номер выпуска 2
Страницы
139-148
Аннотация
С использованием направленно сконструированных производных ранее полученных адипат-продуцирующих штаммов Escherichia coli MG1655 lacIQ, ∆ackA-pta, ∆poxB, ∆ldhA, ∆adhE, PL-SDϕ10-atoB, Ptrc-ideal-4-SDϕ10-fadB, ∆fadE, PL-SDϕ10-tesB, ∆yciA, Ptrc-ideal-4-SDϕ10-fabI, PL-SDϕ10-paaJ, ∆aceBAKϕ, ∆glcB и MG1655 lacIQ, ∆ackA-pta, ∆poxB, ∆ldhA, ∆adhE, PL-SDϕ 10-atoB Ptrc-ideal-4-SD ϕ10-fadB, PL-SDϕ10-tesB, ∆yciA, Ptrc-ideal-4-SDϕ10-fadE, PL-SDϕ10-paaJ, ∆aceBAK, ∆glcB продемонстрирована принципиальная возможность биосинтеза этой бактерией субериновой кислоты из глюкозы в результате обращения природного пути β-окисления жирных кислот. Конденсация ацетил-КоА с сукцинил-КоА и адипил-КоА обеспечивалась в рекомбинантах 3-оксоадипил-КоА тиолазой PaaJ, тогда как предполагаемая ацетил-КоА С-ацетилтрансфераза YqeF была неспособна к катализу соответствующих реакций. Биосинтез субериновой кислоты на уровне ~60 мкМ был достигнут при значительном усилении в штаммах экспрессии гена бифункциональной (S)-3-гидроксиацил-КоА-дегидрогеназы/еноил-КоА-редуктазы, fadB. Последующая инактивация в штаммах сукцинатдегидрогеназы повышала внутриклеточную доступность сукцинил-КоА для инициации первого раунда обращения цикла и способствовала росту накопления рекомбинантами целевого соединения до ~75 мкМ. Полученные результаты создают основу для разработки высокоэффективных штаммов-продуцентов для биотехнологического производства субериновой кислоты из возобновляемого сырья.
Ключевые слова
β-окисление жирных кислот метаболическая инженерия субериновая кислота тиолаза Escherichia coli
Дата публикации
12.11.2024
Год выхода
2024
Всего подписок
0
Всего просмотров
19

Библиография

  1. 1. Tarasava K., Lee S.H., Chen J., Köpke M., Jewett M.C., Gonzalez R. // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2022. V. 49. № 2. kuac003. https://doi.org/10.1093/jimb/kuac003
  2. 2. Fujita Y., Matsuoka H., Hirooka K. // Mol. Microbiol. 2007. V. 66. № 4. P. 829-839.
  3. 3. Kim S., Cheong S., Chou A., Gonzalez R. // Curr. Opin. Biotechnol. 2016. V. 42. P.206-215. https://doi.org/10.1016/j.copbio.2016.07.004
  4. 4. Dellomonaco C., Clomburg J.M., Miller E.N., Gonzalez R. // Nature. 2011. V. 476. P. 355-359. https://doi.org/10.1038/nature10333
  5. 5. Gulevich A.Y., Skorokhodova A.Y., Sukhozhenko A.V., Shakulov R.S., Debabov V.G. // Biotechnol. Lett. 2012. V. 34. P. 463-469. https://doi.org/10.1007/s10529-011-0797-z
  6. 6. Mehrer C.R., Incha M.R., Politz M.C., Pfleger B.F. // Metab. Eng. 2018. V. 48. P. 63-71. https://doi.org/10.1016/j.ymben.2018.05.011
  7. 7. Chen J., Gonzalez R. // Metab. Eng. 2023. V. 79. P. 173-181. https://doi.org/10.1016/j.ymben.2023.07.007
  8. 8. Kim S., Clomburg J.M., Gonzalez R. // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2015. V. 42. P. 465-75. https://doi.org/10.1007/s10295-015-1589-6
  9. 9. Kim S., Cheong S., Gonzalez R. // Metab. Eng. 2016. V. 36. P. 90-98. https://doi.org/10.1016/j.ymben.2016.03.005
  10. 10. Gulevich A.Y., Skorokhodova A.Y., Debabov V.G. // Biomolecules. 2024. V. 14. 449. http://doi.org/10.3390/biom14040449
  11. 11. Cheong S., Clomburg J.M., Gonzalez R. // Nat. Biotechnol. V. 34. № 5. P. 556-561. https://doi.org/10.1038/nbt.3505
  12. 12. Lang M., Li H. // ChemSusChem. 2022. V. 15. № 1. e202101531. https://doi.org/10.1002/cssc.202101531
  13. 13. Liao Z., Yeoh Y.K., Parumasivam T., Koh W.Y., Alrosan M., Alu’datt M.H., Tan T.C. // RSC Adv. 2024. V. 14. № 24. P. 17008-17021. https://doi.org/10.1039/d4ra02598a
  14. 14. Гулевич А.Ю., Скороходова А.Ю., Дебабов В.Г. // Прикл. биохимия и микробиология. 2023. Т. 59. № 3. С. 235-243.
  15. 15. Гулевич А.Ю., Скороходова А.Ю., Дебабов В.Г. // Прикл. биохимия и микробиология. 2023. Т. 60. № 3. С. 28-35.
  16. 16. Sambrook J., Fritsch E., Maniatis T. // Molecular Cloning: a Laboratory Manual, 2 nd Ed., N.Y.: Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989. 1659 р.
  17. 17. Скороходова А.Ю., Стасенко А.А., Гулевич А.Ю., Дебабов В.Г. // Прикл. биохимия и микробиология. 2018. Т. 54. № 3. С. 244-252.
  18. 18. Skorokhodova A.Y., Gulevich A.Y., Debabov V.G. // Biotechnol. Rep. 2022. V. 33. e00703. http://doi.org/10.1016/j.btre.2022.e00703
  19. 19. Datsenko K.A., Wanner B.L. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2000. V. 97. № 12. Р. 6640-6645.
  20. 20. Каташкина Ж.И., Скороходова А.Ю., Зименков Д.В., Гулевич А.Ю., Минаева Н.И., Дорошенко В.Г., Бирюкова И.В., Машко С.В. // Молекулярная биология. 2005. Т. 39. № 5. С. 823-831.
  21. 21. Гулевич А.Ю., Скороходова А.Ю., Ермишев В.Ю., Крылов А.А., Минаева Н.И., Полонская З.М. и др. // Молекулярная биология. 2009. Т. 43. № 3. С. 547- 557.
  22. 22. Clark D.P., Cronan J.E. // EcoSal Plus. 2005. V. 1. 10.1128/ecosalplus.3.4.4. https://doi.org/10.1128/ecosalplus.3.4.4.
  23. 23. Binstock J.F., Schulz H. // Methods. Enzymol. 1981. V. 71. P. 403-411. https://doi.org/10.1016/0076-6879 (81)71051-6
  24. 24. Teufel R., Mascaraque V., Ismail W., Voss M., Perera J., Eisenreich W., Haehnel W., Fuchs G. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2010. V. 107. № 32. P. 14390-14395. https://doi.org/10.1073/pnas.1005399107
  25. 25. Deuschle U., Kammerer W., Gentz R., Bujard H. // EMBO J. 1986. V. 5. P. 2987-2994. https://doi.org/10.1002/j.1460-2075.1986.tb04596.x
QR
Перевести

Индексирование

Scopus

Scopus

Scopus

Crossref

Scopus

Высшая аттестационная комиссия

При Министерстве образования и науки Российской Федерации

Scopus

Научная электронная библиотека